Dalam upaya pencegahan angka stunting, Puskesmas Kilan melakukan kegiatan yang melibatkan beberapa lintas program dan lintas sektor seperti KIA,Gizi,Imunisasi, kesehatan lingkungan, dokter, bidan, promkes, petugas surveilan kecacingan, kader stunting desa, PLKB, dan pemerintah desa. Kegiatan Peduli Stunting yang rutin dilakukan di Puskesmas Kilan seperti pemantauan pertumbuhan balita melalui penimbangan dan pengukuran/panjang badan, pembagian PMT, edukasi dan praktik gizi tentang Pemberian Makanan Bayi dan Anak (PMBA), edukasi ASI Ekslusif bersama keluarga balita, pemberian obat cacing dan vitamin A, antenatal care (ANC), konseling pranikah, pemantauan pola asuh anak, skrining anemia dan pemberian tablet tambah darah pada remaja putri SMP dan SMA.